はてなダイアリーのように、エントリーのタイトル部分からカテゴリーのアーカイブにリンクするには、Main Indexテンプレートにある

<$MTEntryTitle$>

という部分を、

[ 
<$MTEntryCategories$>
 <a href="<$MTCategoryArchiveLink$>">
  <$MTCategoryLabel$>
 </a>
</MTEntryCategories>
] 
<$MTEntryTitle$>

と記述する。ページ上での表示は

[カテゴリー名] エントリーのタイトル

となり、カテゴリー名からはカテゴリーのアーカイブにリンクされる。